双方争论十余天,互不相让。各总兵、海道承姚启圣的嘱咐,力劝施琅权依督臣之议。五月十六日,宁海将军喇哈达、侍郎吴努,到达铜山,闻悉督、提意见分歧,他们立即作出“平海事关重大,奉旨督提同心,岂可各执己见,当请展期”的决定。施琅因不便违抗,不得不听从姚启圣等人,这实非他的本意。
施琅为了进一步了解敌情和选定出征日期,即遣赶缯快船二十三只,令随征总兵董义等率领船队前往澎湖侦察。船队于六月初四日黎明从古雷出发,初五日下午至澎湖,在花屿前湾泊,初六日黎明船队进抵狮屿头,瞭见刘国轩等人的船只通通布列在娘妈宫前。郑军一发现清军,立刻从西屿头、八罩山分别发出大小战船三十余只追击。董义忙命各船归腙返回,初七日入境,初八日顺利抵达厦门。这次,施琅遣发哨船侦探,来去无阻,既摸清了敌情,又证实乘南风进取显见成效,这更增强了他的信心。
其实,姚启圣、施琅两人的分歧,关键在于各自对形势的不同估计及对待剿抚有别的深层矛盾上。
姚启圣十分重视招抚工作,他出任总督后,便颁发招抚赏格十款,凡不同形式的投诚官兵与出面招抚人员,以其贡献大小,一一给予不等的奖励。对投诚官兵的安置工作,也做了具体规定。为了使招抚活动经常化,还特地建立修来馆,派员专门负责收纳投诚将士。此外,他又不时派间谍潜入澎、台,在郑军内部进行策反。他曾给郑宾客司傅为霖、续顺公沈瑞送去绫札重赏,策动傅为霖等纠联十一镇兵力协谋内应。在傅为霖等谋叛失败后,姚启圣还上疏请求给谋反将士于常格之外,量加忧恤,以感召更多的郑军官兵起来反叛。