所谓木主，就是牌位，文庙大殿里没有塑像，只在正中的位子，竖立一块书有“至圣先师孔子牌位”的木板。
朱元璋的这道圣旨，是仅限于太学中的文庙呢还是普及于全国的文庙，已是不得而知。兹后内阁的孔子像易为木主，却是有据可查。但是，我参观过几座明代留下的文庙，如云南建水、山东曲阜等处，孔子仍然塑像庄严。即便是后人重修，在明代，木主之旨亦未在州县得到有力的推行。如天顺六年三月，朱元璋去世一百多年后，苏州府的文庙塑像剥落，教谕等官员倡议修饰，增其庄严。知府林鹗说：“塑像非古，洪武皇帝视察太学时，下旨易为木主。那尊太学的孔子像并未坏朽，尚且被皇上毁掉。如今我们苏州文庙的这尊塑像已剥落，还修他做甚，易为木主可也。”
林鹗话音一落，教谕就小心提醒：“知府大人，毁孔子像就是对圣贤不敬，还望三思而行。”刘鹗笑道：“什么圣贤，这不就是一堆泥土吗？”林鹗态度坚决，且敢承担风险，苏州文庙的塑像，这才彻底拆除，换成木主了。又过了数年，到了嘉靖七年，时任内阁首辅的张璁向世宗皇帝建议：拆除全国文庙的塑像，一律改为木主。世宗准奏，这事儿才在全国正式推行。