3日，政府军将特警队员包围，要求“反叛分子”放下武器，和平解决问题。可特警队员毫不理会，继续与政府军对抗。阿利耶夫不得不中断在美国的访问，赶回巴库。3日晚，阿利耶夫即在国家电视台露面，并发表讲话说：“巴库最近发生的事件是一次未遂政变，一些势力试图搞乱阿塞拜疆局势，从内部颠覆国家，不择手段以达到其卑鄙目的。”在讲话中还宣布了一项命令：“10月3日20点开始在巴库实行紧急状态，为期60天。”
当政府军与特警队员对峙之际（4日），阿塞拜疆第二大城市占贾也发生叛乱。一批武装人员占领了市执委会大楼、机场、火车站、国家安全部市管理局等重要机关。期间，巴库还发生了4名身为高级军官的案犯从国家安全部侦讯隔离室逃跑和10名被判死刑的重犯越狱的严重事件。这一连串事件震撼了全国，阿利耶夫总统呼吁巴库人民起来捍卫国家主权和法律。人民也走上街头举行集会，声讨叛乱行径。